La France est particulièrement riche en monuments historiques en pierre. Malgré sa plus grande résistance aux agressions de toutes sortes par rapport à d'autres matériaux, la plupart des sites patrimoniaux en pierre sont aujourd'hui fortement affectés par les fluctuations environnementales, la pollution atmosphérique et le changement climatique. Parmi les dangers auxquels sont confrontés ces monuments en pierre, il y a des phénomènes géologiques et des phénomènes microbiologiques regroupés sous le terme de phénomènes géomicrobiologiques. Le travail consistera en une étude de cas (église troglodyte Notre Dame de l’Annonciation sur la commune de Haute-Isle dans le Véxin). L’église entièrement excavée dans la craie présente un fort développement biologique qui recouvre une grande partie des murs et du plafond. Les zones de développement de biofilm semblent soumises à une forte humidité et à une importante luminosité. Une partie du travail consistera à mettre en place un recueil de données climatiques dans la nef (relevés de température et d’hygrométrie), à cartographier le développement biologique et à le caractériser par colorimétrie. Des prélèvements de biofilm seront réalisés en différentes zones du biofilm présentant des aspects macroscopiques variés. Ces prélèvements seront analysés par microscopie au niveau de la plate-forme d’imagerie de l’Institut des matériaux de Cergy par microscopie confocale à balayage laser et microscopie électronique à balayage. Ils seront mis en culture sur différents milieux solides et liquides afin d’en caractériser la flore cultivable. Les microorganismes isolés seront identifiés par des approches phénotypiques et moléculaires.
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