Le processus de néolithisation au Maghreb oriental reste à ce jour mal documenté. Le grand nombre de sites capsiens par rapport aux rares sites néolithiques et le caractère particulier de ces derniers (pastoralisme semi-nomade et émergence tardive de l’agriculture) questionnent la définition européo-centrée du Néolithique. Il est finalement admis que les sociétés humaines se sont adaptés adaptées aux changements climatiques récurrents depuis environ 9 ka cal BP et ont démontré une forte capacité de résilience en s'adaptant et en subsistant dans des écosystèmes steppiques fragiles. Cependant, la nature des forçages environnementaux et des activités humaines émergentes n’a jamais encore été étudiée dans un cadre spatial et chronologique robuste pour retracer la genèse et l’évolution des socio-écosystèmes en région semi-aride. Cette thèse propose de combler le manque de données paléoenvironnementales au Maghreb oriental en réalisant l’analyse palynologique (pollen et microfossiles non-polliniques-MNP) à haute résolution, en diachronie sur tout l’Holocène, d’un transect terre-mer de deux archives sédimentaires (Golfe de Gabès et Tunisie centrale). En parallèle, un référentiel actualiste d’échantillons de sol, de mousse, de fèces d’animaux domestiques et sauvages et de racines sera constitué pour calibrer la relation pollen-végétation/champignon et identifier des biomarqueurs polliniques et fongiques des différents groupements de végétation et de l’anthropisation dans ces milieux semi-arides. L’ensemble des données écologiques et paléoécologiques seront corrélées entre elles et avec les données archéologiques disponibles par des traitements statistiques (Squared Chord Distance, ACP, entre autres) et de fouilles de données (data mining) particulièrement adaptés aux corpus de différentes natures. Ces analyses permettront de dégager des groupements fonctionnels de bio-indicateurs co-évoluant ensemble (motifs graduels fermés) dont la nature et la répétition seront associés à la variabilité climatique et aux activités humaines.
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